Pärnu muuseumi varsti juba 120 aasta pikkuses ajaloos algas kõige kiirem areng 1940. aastal. Suur-Saksamaa kutsel Pärnust lahkunud baltisakslaste muinasuurijate seltsilt Pärnu arheoloogia seltsile üle antud muuseum natsionaliseeriti ja muudeti “riiklikuks asutuseks kohalikul eelarvel”.
Omal ajal entusiastide moodustatud, kuid baltisakslaste majandusliku ja sotsiaalse kärbumise tõttu pea toetuseta jäänud muuseumi ei olnud üle võtnud Eesti Vabariigi Pärnu linnavalitsus. Võimalik, et järgmise viie aasta jooksul oleks seda tehtud ja suudetud vanast muuseumist kujundada moodne linnamuuseum, kuid 1940. aasta pöördelised sündmused ei võimaldanud senistel arengutel enam ilmneda.